Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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