Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms