Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms