Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms