Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms