Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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