Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms