Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp1Q9QY53 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms