Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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