Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capn15Q9JLG8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms