Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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