Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hmgn3Q9DCB1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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