Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf6Q9DBU5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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