Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot8Q9D8X5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms