Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms