Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ube2cQ9D1C1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms