Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms