Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Tmem88Q9D0N8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tmem88Q9D0N8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tmem88Q9D0N8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tmem88Q9D0N8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem88Q9D0N8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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