Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PmpcbQ9CXT8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms