Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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