Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms