Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms