Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms