Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms