Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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