Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl43Q99N89 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms