Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac9Q99N13 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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