Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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