Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RtcbQ99LF4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms