Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms