Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Riok1Q922Q2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok1Q922Q2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms