Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms