Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms