Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms