Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms