Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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