Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6DFW0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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