Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Msl2Q69ZF8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms