Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col4a5Q63ZW6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms