Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms