Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms