Protein–RNA interactions for Protein: Q61850

Foxc2, Forkhead box protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxc2Q61850 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Foxc2Q61850 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms