Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms