Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps54Q5SPW0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms