Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim80Q3V061 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim80Q3V061 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim80Q3V061 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim80Q3V061 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim80Q3V061 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim80Q3V061 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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