Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms