Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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