Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms