Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms