Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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